環境及自然保育基金申請及管理系統（Smart ECF）是為合資格用戶作申請和管理環境及自然保育基金（ECF）項目的一站式電子系統，並由環境及自然保育基金委員會秘書處（秘書處）負責管理。申請機構成功註冊Smart ECF帳戶後，可透過系統集中地處理有關申請及獲批項目的事宜，包括提交申請表格及補充資料、查看申請狀況、管理項目及帳戶資料，亦可在系統上與秘書處聯繫。

Smart ECF首階段已開放予有興趣申請環境及自然保育基金的合資格機構進行帳戶註冊。秘書處亦將就不同資助計劃推出Smart ECF網上申請，供已成功註冊Smart ECF帳戶的機構負責人（即申請機構的主管或副主管）於邀請申請期内透過Smart ECF遞交網上申請，相關的推出日期將適時公佈。

秘書處鼓勵機構盡量使用電子系統遞交申請，以減少紙張使用及享受電子方式呈交文件所帶來的便利。